药店成本核算方法是药店自行选择，没有统一规定的。比如可以按月末一次加权平均法进行成本核算。销售药品结转成本的分录是，

借：主营业务成本，

贷：库存商品。

销售药品结转成本金额=销售数量*单位药品成本。